Moin Thomas,
ehrlich gesagt bin ich total unschlüssig nach Deinen Aussagen. Da die Start/Stop ja einwandfrei funzt, sehe ich nicht da das Schalter defekt ist. Etwas mechanisches erscheint mit da doch wahrscheinlicher zu sein. Hatt das Pedal eventuell etwas Spiel, ist das Lager vom Pedal nicht ganz in Ordnung oder knarzt die Rückholfeder ein wenig?
Ein Klicken kann ja auch entstehen, wenn sich die Feder leicht verdreht beim Treten der Kupplung.
Das Thema mit der relativ hohen Leerlauf Drehzahl von 1000 U/min wird andere Gründe haben, wobei ich nicht weiß, wie sich die Drehzahl beim Start/Stop System verhalten soll. Aber das Verhalten, welches Du nach dem Starten des Motors beschreibst klingt für mich zumindest Plausibel.
Eine Frage noch, womit misst Du die Drehzahl? Mit dem Kombiinstrument oder mit einem Tester?