Kurz zusammengefasst: Da das original Radio kein Chinch-Ausgang besitzt musst du das Musiksignal von den Lautsprecherausgängen holen, hier ist es eigentlich egal, an wecher Stelle dies geschieht, aber die hinteren Lautsprecher sind nunmal näher am Kofferraum. Dieses hochpegelige Signal muss in einen Hochpegeleingang, der bei den meisten PnP Lösungen standard ist (würde ich auch hier empfehlen).
Dann noch ein Stromkabel von der Batterie, über eine Sicherung in den Innenraum und unter der Verkleidung nach hinten verlegt, und das Massekabel an der Karosserie befestigen (auf guten Kontakt achten).
Bei Remote ist jeder aktiv Sub anders, manche besitzen eine Einschaltautomatik, die aktiviert wird, wenn ein Signal über die Lautsprecherausgänge rein kommt oder der klassische Weg, es müssen 12V am Remoteeingang anliegen, hierfür nach Klemme 15 suchen (z.B. beim Pannenset im Kofferraum, Sicherungskasten oder Zigarettenanzünder).
Mit "kläppern" mein dein Kollege, das sich der Zwischenbode durch die Schallwellen auf & ab bewegt, da es ein relativ kleiner geschlossener Raum ist. Das kommt dann wieder auf die Leistung des Subs und die Lautstärke an. Bei der angestrebten Größe glaube ich aber nicht, das sich da was merkbar bewegt, zumal dort alle Kanten gepolstert sind.